本校為佛光山開山宗長 － 星雲大師，在推展佛教事業卓然有成之際，秉持一貫慈悲普濟之精神，發心利用佛光山特有的幽雅環境，創辦一所中學，以作育英才，造福社會。

在民國六十六年建校之初，即揭櫫四項目標，作為建校宗旨：

• 普門乃是普度一切眾生之門，是大慈大悲觀世音菩薩救世精神的弘揚。
• 普門是普為社會大眾設立之門，是至聖先師孔子有教無類理想的實現。
• 普門中學是以佛教救世精神，融合教育理想，大慈平等、博愛無私為宗旨。
• 普門中學以生活教育為先，造就五育並進，品學兼優之青年，貢獻社會，造福邦家為目標。

本校原名高雄縣正氣中學，創設於高雄縣岡山鎮。六十六年創校時即奉台灣省政府教育廳核准，更名為 「高雄縣普門高級中學」，並遷校於高雄縣大樹鄉佛光山內。

九十七年一月遷離佛光山南方約三公里處，新校區（大樹區大坑路） 佔地8.5公頃，校舍新穎、建築宏偉。

• 本校原名高雄縣正氣中學，創校於高雄縣岡山鎮。
• 66 年 7 月星雲大師以佛教濟世精神回饋社會，接辦正氣中學，遷校高雄縣大樹鄉佛光山，並奉台灣省政府教育廳核准更名為 「高雄縣普門高級中學」。
• 66 年 8 月首任校長慈惠法師，初期設初中部，第一屆招生錄取新生35名。
• 67 年 8 月設觀光事業科及幼保科，68 年 8 月設高中部。
• 72 年 8 月陳開宇（慧開法師）接任校長。與韓國東國大學附設高中締結姊妹校。
• 75 年 8 月成立家政科。
• 79 年 7 月董事會通過慈惠法師為第二任董事長。當年並與韓國明星女中及美國加州諾加力士高中締結姊妹校。
• 79 年 7 月聘請王廷二先生為校長。
• 84 年 10 月董事會聘請劉美英（依淳法師）為校長。
• 86 年 7 月聘請慧開法師為校長。
• 87 年 7 月聘請陳迺臣博士為校長。
• 89 年 7 月聘請葉明燦先生為校長。
• 91 年 7 月董事會通過心定和尚為第三任董事長。增設資料處理科。
• 95 年 7 月董事會通過慧傳法師為第四任董事長。
• 95 年 8 月聘請蔡國權先生為代理校長。
• 96 年 2 月聘請林清波先生為校長。
• 97 年 2 月本校遷至大樹鄉大坑村（路）140 之 11 號新校區。
• 99 年 2 月聘請陳椿榮先生為代理校長。
• 99 年 8 月聘請蕭金榮先生為校長。
• 99 年 7 月新校區操場落成啟用。
• 99 年 7 月新校區三好館（籃球場）落成啟用。
• 100 年 8 月本校榮獲三好校園實踐學校殊榮。
• 100 年 8 月榮獲教育部高中優質化、均質化經費補助。
• 101 年 8 月再度榮獲三好校園實踐學校殊榮。
• 101 年 8 月榮獲教育部高中優質化、均質化經費補助。
• 102 年 4 月三好館楓木地板更新啟用。
• 102 年 8 月聘請蔡清波先生為校長。
• 102 年 8 月本校成立高中部棒球隊。
• 102 年 8 月連續三年榮獲三好校園實踐學校殊榮。
• 102 年 8 月榮獲教育部高中優質化、均質化經費補助。
• 102 年 9 月本校榮獲全國高中職體育績優學校，全國私校唯一獲獎。
• 102 年 9 月本校榮獲全國優質高中認證。
• 103 年 3 月本校榮獲高雄市教育局國中校務評鑑為優等學校。
• 103 年 4 月本校榮獲教育部高中校務評鑑為優等學校。
• 103 年 8 月室內棒球打擊場及標準室外棒球場相繼落成啟用。
• 104 年 8 月健康促進學校評鑑優等。
• 105 年 1 月本土教育訪視優等。
• 105 年 8 月榮獲三好校園典範學校殊榮。
• 105 年 8 月榮獲教育部高中優質化第二期程第一年計畫及均質化經費補助。
• 105 年 8 月聘請蔡國權先生為代理校長。
• 105 年 9 月本校再度榮獲全國高中職體育績優學校（第二次）。
• 105 年 12 月茶禪一味文化教室落成啟用。
• 106 年 2 月棒球隊榮獲全國木棒聯賽季軍。
• 106 年 3 月女籃隊榮獲全國HBL冠軍。
• 106 年 4 月體操隊榮獲全國中等學校運動會高女組暨國女組亞軍。
• 106 年 6 月本校榮獲教育部國中校務評鑑為特優學校。
• 106 年 5 月聘請蔡國權先生為校長。
• 106 年 5 月 17 日與大韓民國東國大學校師範大學附屬高等學校締結姊妹校。
• 106 年 1 月棒球隊榮獲全國硬式鋁棒聯賽冠軍。
• 106 年 12 月食農園區落成啟用。
• 107 年 2 月棒球隊榮獲全國木棒聯賽亞軍。
• 107 年 3 月女籃隊榮獲全國HBL冠軍。
• 107 年 4 月體操隊榮獲全國中等學校運動會國女組季軍。
• 107 年 6 月柴燒窯教室落成啟用。
• 107 年 9 月高雄市品德教育標竿學校。
• 107 年 9 月高雄市體育有功人員績優體育團體獎。
• 107 年 10 月本校榮獲全國高中職體育績優學校（第三次）。
• 107 年 10 月教育部品德教育特色學校。
• 107 年 11 月高雄市推動閱讀績優學校。
• 108 年 2 月國家防災日地震避難掩護演練績優學校。
• 108 年 3 月女籃隊榮獲全國 HBL 季軍。
• 榮獲 「107 年度全國品德教育」 特色學校。
• 榮獲 107 年度教育部體育署體育績優學校（三次榮獲）。
• 榮獲 「高雄市 107 年度推動品德實踐運動」 特優學校。
• 榮獲 107 年高雄市體育有功人員-績優體育團體獎。
• 107 年本校三度榮獲全國高中職體育績優學校。
• 108 年國家防災日地震避難掩護演練績優學校第三名。
• 108 年女籃隊榮獲全國 HBL 季軍。
• 108 年全國學生音樂比賽高雄市初賽榮獲東區國中組管樂合奏 (B 組) 優等。
• 108 年高雄市原住民族語歌謠比賽團體乙組榮獲第二名。
• 108 年體操隊榮獲全國體操錦標賽高女組團體亞軍。
• 女籃隊榮獲高雄市 108 年度體育績優團體。
• 榮獲高雄市 108 年度家庭教育績優學校。
• 108 學年度國中課程計畫榮獲高雄市值得推薦學校 (全市九所，本校唯一私校)。
• 108 年 11 月 4 日與韓國東國大學校師範大學附屬女子高等學校締結姊妹校。
• 109 年棒球隊榮獲 108 學年度學生棒球運動聯賽高中木棒組全國賽季軍。
• 榮獲教育部 「109 年全國防制學生藥物濫用績優單位」。
• 榮獲國教署 109 年國家防災日評選第一名。
• 榮獲高雄市 109 年國家防災日演練績優學校第一名。
• 榮獲 109 年度教育部體育署體育績優學校(第四次)。
• 榮獲高雄市 109 年度推動品德實踐運動特優學校。
• 榮獲高雄市 109 年度家庭教育績優團體。
• 110 年市中運：本校體操隊榮獲高中組團體榮獲第二名、國中組團體榮獲第二名。